Kapalai si trova nel Borneo Orientale, al centro del Mar di Celebes, e fa parte del Parco Marino di Semporna insieme alle isole di Sipadan, Mabul, Mataking e Pom Pom.L’isola di Kapalai ha dimensioni minuscole. Vi è presente un’unica struttura chiamata Kapalai Dive Resort, una struttura eco compatibile in legno, poggiata interamente su palafitte. Dall’isola è possibile raggiungere diversi punti di immersione, oltre quelli dislocati attorno a Sipadan. A seconda della stagione di migrazione è possibile anche vedere squali balena.